2014年10月8日 星期三

DisGeNET 網路工具的應用

DisGeNET網址如下:

http://www.disgenet.org/web/DisGeNET/v2.1/home


 1. 進入頁面(home)後,會看到有關DisGeNET的簡介
     包含網站設置原因及特點,且任何的資料庫更新也都有做紀錄。













2. 看完簡介後之後,可點選"Search" 搜尋想要了解的基因
    此次我搜尋了一個在seminar paper裡提到的基因cxcr2。













3. 等待一陣子,就會跳出搜尋結果
    顯示的結果可確定是我要找的基因cxcr2, chemokine (C-X-C motif) receptor 2
    可繼續點選底下的連結,進一步了解此基因相關的疾病及其他基因。




4.  搜尋Top10 disease associations for cxcr2
     點數最高的前三名相關疾病為 結腸炎,乳腺炎及敗血症
     與之前所學符合,CXCR2與發炎反應相關。













點選左下Browse details還可以得到詳細的疾病資訊包含疾病的編號,類型,文獻等等。













5. 另外也可以搜尋Table of genes that share diseases with cxcr2
    可發現前十名相關基因大部分都是cytokine與chemokine的基因













    一樣點選左下Browse details會出現這些相關基因的簡介
    譬如參與的機制以及其蛋白的角色,
    可發現很多都是參與訊號傳遞的分子也與免疫機制相關。








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